微生物源残体碳标识物——氨基糖|茁彩生物
氨基糖以其独特的结构和功能,成为了众多生物大分子不可或缺的组成成分。作为一类糖的羟基被氨基所取代的化合物,氨基糖在自然界中广泛存在,是壳聚糖、抗生素、脂多糖、糖蛋白和黏多糖等多种生物活性物质的重要组成部分。
氨基糖的来源主要有两种:一是微生物的代谢产物,二是微生物细胞壁的残留。在微生物的生命周期中,氨基糖作为细胞壁的重要结构成分,发挥着支撑和保护细胞的重要作用。而当微生物死亡后,其细胞壁中的氨基糖能够在环境中保持较高的稳定性和微生物异源性,具有较长的保存时间。这一特性使得氨基糖成为了研究微生物群落动态变化和土壤有机质积累的理想标识物。
目前,科学家们已经能够从土壤微生物残体中识别出26种不同的氨基糖。然而,由于技术条件的限制,仅有胞壁酸(MurA)、氨基葡萄糖(GlcN)、氨基半乳糖(GalN)和氨基甘露糖(ManN)这四种氨基糖能够被有效提取并量化。这四种氨基糖各具特色,它们在土壤中的含量与分布,不仅反映了微生物的种类与数量,还揭示了微生物在不同环境条件下的适应策略与生存状态。
氨基葡萄糖
又称为葡萄糖胺,广泛存在于微生物和动物的多糖结构中。它可以通过从天然的甲壳素中提取而获得,例如从虾和蟹的外壳中提取。作为蛋白质或脂类糖基化反应的重要前体,氨基葡萄糖具有不可替代的作用。
氨基半乳糖
亦称为半乳糖胺,是一种广泛存在于糖蛋白、寡糖和糖胺聚糖中的氨基糖。它在土壤中是第二常见的氨基糖,其对土壤中氨基糖的贡献率范围在17%到42%之间。此前,研究人员普遍认为氨基半乳糖的主要来源是细菌,但最近的研究显示,真菌在这一过程中所起的作用同样不可小觑。了解氨基半乳糖的来源与作用,对于深入研究土壤生物学和生态系统功能具有重要意义。
氨基甘露糖
氨基甘露糖在土壤中的含量相对较低,其对土壤中氨基糖的贡献率大约为4%。这一数值表明,氨基甘露糖并不特别针对某一种微生物群体,原因在于它在不同类型的微生物中都有生成。具体来说,无论是在细菌还是在真菌中,均能发现氨基甘露糖的生成。例如,在真菌的唾液酸中、细菌的磷壁酸中,以及革兰氏阳性菌的土壤中胞外聚合物中,都可以检测到氨基甘露糖的存在。这显示了氨基甘露糖在微生物生态系统中的广泛分布和相对普遍的生物合成途径。
胞壁酸
胞壁酸是细菌细胞壁中肽聚糖的重要成分,其主要来源于细菌。研究表明,胞壁酸在土壤中对氨基糖的贡献率介于3%到16%之间,使其成为土壤中最具特异性的细菌生物标志物。这一特征使胞壁酸能够有效指示微生物,尤其是细菌,在土壤生态系统中的贡献程度。此外,胞壁酸的含量可以用来评估环境中微生物的丰度,反映微生物污染的严重程度,评估土壤的肥力水平,并且在一定情况下,可以代表植物组织的病变程度。因此,胞壁酸不仅在微生物生态研究中具有重要意义,也在土壤健康评估和管理中发挥着关键作用。